重慶三峽中心醫院兒童分院的前身系中心醫院小兒科。該科成立于1945年，曾先后榮獲萬州區、重慶市、全國“巾幗文明示范崗”及重慶市“三八紅旗集體”等榮譽稱號。經過五十余年的櫛風沐雨，目前已發展壯大成為集兒童疾病診斷、治療、保健、臨床教學任務于一體，服務范圍覆蓋三峽庫區及周邊23個區縣，專業設置齊全、技術力量雄厚、醫療設備完善的特色兒童專科醫院，是三峽庫區第一家也是唯一的一家兒童專科醫院。
　　重慶三峽中心醫院兒童分院地處萬州區新城路、王牌路、太白路三條城區交通干線的交匯處，門前車水馬龍、熙來攘往，入內則寧靜舒適、別有洞天。大樓整體設計獨具特色，內部裝修充滿童趣，病房設施高檔舒適，建筑面積達17300平方米，于2004年8月正式啟用。現有編制床位300張，設有兒內一、兒內二、兒外、兒童重癥監護中心、兒童保健康復、門診、急診、兒童口腔、兒童五官、醫技等多個配套科室。
　　重慶三峽中心醫院兒童分院擁有一支業務技術精湛、醫德醫風高尚的專業技術隊伍。現有專業技術人員250余人，其中正高職稱專家5人，副高職稱專家13人，實行24小時全天侯診治，能為14周歲以下兒童（包括新生兒）的身心健康和疾病診治提供可靠的技術保證。并承擔了川北醫學院、第三軍醫大學、瀘州醫學院等高等醫學院校兒科學教學實習任務及基層醫院兒科醫師進修培訓任務，每年接納進修實習生200余人次。
　　重慶三峽中心醫院兒童分院采用中央空調、中心供氧、信息處理自動化等到現代化裝置，擁有小兒呼吸機、多參數心電監護儀、微量輸液泵、嬰兒高壓氧艙、新生兒紅外線輻射搶救臺、恒溫箱、兒童肺功能檢測儀等先進的兒科專用醫療設備，并依托總院擁有美國通用X射線斷層檢查儀、德國西門子醫用直線加速器、磁共振成像系統、美國通用彩色多普勒超聲診斷儀、日立全自動生化分析儀等大批大、中型先進醫療設備的“資源共享權”，能夠多層次、全方位地滿足患兒就醫的需求。
　　重慶三峽中心醫院兒童分院全體醫護人員將嚴格遵循“團結進取、仁愛慎獨、德高醫精”的院訓要求，秉承嚴謹求實的工作作風，患兒至上的服務宗旨，創新奮進的管理模式，以百倍的努力，千倍的愛心，情傾患兒，回報社會，借醫療衛生改革的東風，為創建三峽庫區乃至全國一流的兒童醫院而努力奮斗！